| Pt | MP | W | D | L | F | A | GD | |||
| 1 | ヴィッセル神戸 | 71 | 34 | 21 | 8 | 5 | 60 | 29 | 31 | ACL |
| 2 | 横浜F・マリノス | 64 | 34 | 19 | 7 | 8 | 63 | 40 | 22 | ACL |
| 3 | サンフレッチェ広島 | 58 | 34 | 17 | 7 | 10 | 42 | 28 | 14 | ACL |
| 4 | 浦和レッドダイヤモンズ | 57 | 34 | 15 | 12 | 7 | 42 | 27 | 15 | |
| 5 | 鹿島アントラーズ | 52 | 34 | 14 | 10 | 10 | 42 | 33 | 9 | |
| 6 | 名古屋グランパス | 52 | 34 | 14 | 10 | 10 | 41 | 36 | 5 | |
| 7 | アビスパ福岡 | 51 | 34 | 15 | 6 | 13 | 37 | 43 | -6 | |
| 8 | 川崎フロンターレ | 50 | 34 | 14 | 8 | 12 | 51 | 45 | 6 | |
| 9 | セレッソ大阪 | 49 | 34 | 15 | 4 | 15 | 39 | 34 | 5 | |
| 10 | アルビレックス新潟 | 45 | 34 | 11 | 12 | 11 | 36 | 40 | -4 | |
| 11 | FC東京 | 43 | 34 | 12 | 7 | 15 | 42 | 46 | -4 | |
| 12 | 北海道コンサドーレ札幌 | 40 | 34 | 10 | 10 | 14 | 56 | 61 | -5 | |
| 13 | 京都サンガ | 40 | 34 | 12 | 4 | 18 | 40 | 45 | -5 | |
| 14 | サガン鳥栖 | 38 | 34 | 9 | 11 | 14 | 43 | 47 | -4 | |
| 15 | 湘南ベルマーレ | 34 | 34 | 8 | 10 | 16 | 39 | 56 | -17 | |
| 16 | ガンバ大阪 | 34 | 34 | 9 | 7 | 18 | 38 | 61 | -23 | |
| 17 | 柏レイソル | 33 | 34 | 6 | 15 | 13 | 33 | 47 | -14 | |
| 18 | 横浜FC | 29 | 34 | 7 | 8 | 19 | 31 | 58 | -27 | J2 |